Variant 2 for NAD and NADP cofactor biosynthesis global (with 298 genomes present) (functional: [Asp -> NADP]; var fc16)

Statistics
0 Eukaryota (out of 16), 38 Bacteria (out of 261) and 0 Archaea (out of 21) match this variant.
Pathway graph
Note: required functional roles are shown in green box while the optional ones in gray



Annotation spreedsheet
Note 1: annotations for required functional roles are shown in green; click for details;
Note 2: enzymes with the same function are treated equally;
Note 2: each row (organism) contains no more than 2 cells of "miss" (missing gene) or genes (which are annotated in this organism but is optional in above pathway).
GenomeIDOrganism TDO IDO KFA_e KFA_b KMO KYN HAD ASPOX ASPDH QSYN QAPRT NAMNAT NMNAT NADS GAT NADK NAM NAPRT NMPRT PNUC RNK_b RNK_e
207559.1 Desulfovibrio desulfuricans G20 [B] ? ? ? ? ? ? ? 2095 ? 2096 2097 1838 ? miss miss 942 ? ? ? ? ? ?
85963.1 Helicobacter pylori J99 [B] ? ? ? ? ? ? ? miss 1270 1269 1252 ? 309 miss 1429 ? ? ? ? ? ?
74547.1 Prochlorococcus marinus str. MIT 9313 [B] ? ? ? ? ? ? ? 177 ? 661 2064 1454 ? 1455 1455 2008/368 ? ? ? ? ? ?
36870.1 Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis [B] ? ? ? ? ? ? ? miss 156 322 169 ? 340 miss 108 ? ? ? ? ? ?
190304.1 Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 [B] ? ? ? ? ? ? ? 602 ? 601 603 1708 ? 1778 miss 853 ? 932 ? ? ? ?
209882.1 Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii ATCC 49256 [B] ? ? ? ? ? ? ? 878 ? 877 879 1521 ? 2008 miss 1989 ? 1574 ? ? ? ?
273121.1 Wolinella succinogenes DSM 1740 [B] ? ? ? ? ? ? ? 1467 ? 1180 1179 625 ? 191 miss 1482 ? ? ? ? ? ?
1140.1 Synechococcus elongatus PCC 7942 [B] ? ? ? ? ? ? ? 1195 ? 777 294 2414 ? 2415 2415 1179/1605 ? ? ? ? ? ?
84588.1 Synechococcus sp. WH 8102 [B] ? ? ? ? ? ? ? 2185 ? 1311 2311 500 ? 499 499 1594/2261 ? ? ? ? ? ?
167540.1 Prochlorococcus marinus MED4 [B] ? ? ? ? ? ? ? 350 ? 1670 259 727 ? 726 726 292/957 ? ? ? ? ? ?
167539.1 Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 [B] ? ? ? ? ? ? ? 119 ? 1011 213 1595 ? 1596 1596 1340/180 ? ? ? ? ? ?
59919.1 Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986 [B] ? ? ? ? ? ? ? 100 ? 675 188 1441 ? 1442 1442 1265/156 ? ? ? ? ? ?
272558.1 Bacillus halodurans C-125 [B] ? ? ? ? ? ? ? 1218 ? 1220 1219 1326 ? 2285 miss 2848/3199 3777 ? ? ? ? ?
195102.1 Clostridium perfringens str. 13 [B] ? ? ? ? ? ? ? 458 ? 457 459 2188 ? 1121 1121 1880 ? 1270 ? 462 ? ?
227377.1 Coxiella burnetii RSA 493 [B] ? ? ? ? ? ? ? 97 ? 562 94 531 ? 821 821 1232 ? 983 ? ? ? ?
251221.1 Gloeobacter violaceus PCC 7421 [B] 2058 ? ? ? ? ? ? 846 ? 192 888 4016 1660 2587 2587 3525/473 ? ? ? ? ? ?
817.1 Bacteroides fragilis 638R [B] ? ? ? ? ? ? ? 2003 ? 2026 4369 4673 ? 1625 1625 2092 ? 3122 ? 3584 ? ?
817.2 Bacteroides fragilis NCTC9343 [B] ? ? ? ? ? ? ? 3280 ? 3259 3212 3712 ? 1253 1253 1038 ? 3385 ? 692 ? ?
882.1 Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough [B] ? ? ? ? ? ? ? 1802 ? 1801 1800 1946 ? 1604 1604 1880 33 ? ? ? ? ?
85962.1 Helicobacter pylori 26695 [B] ? ? ? ? ? ? ? miss 1344 1343 1325 ? 325 miss 1381 ? ? ? ? ? ?
97084.1 Bacteriovorax marinus SJ [B] 3292 ? ? ? ? ? ? 2821 ? 2709 2822 miss ? 1150 1150 3166 ? ? ? ? ? ?
156405.1 uncultured Chlorobi bacterium [B] ? ? ? ? ? ? ? 1236 ? 1246 1746 2359 ? 161 1141 553 ? ? ? ? ? ?
159087.1 Dechloromonas aromatica RCB [B] ? ? ? ? ? ? ? 506 ? miss 1847 1126 ? 149 149 2607 ? ? ? ? ? ?
160492.1 Xylella fastidiosa 9a5c [B] ? ? ? ? ? ? ? 1917 ? 1916 1918 2165 ? 1950 1950 2076 ? 1094 ? ? ? ?
189518.1 Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 [B] ? ? ? ? ? ? ? 1511 ? 618 3085 855 ? 2989 2989 miss ? ? ? ? ? ?
190650.1 Caulobacter crescentus CB15 [B] 2862 ? ? ? ? ? ? 2887 ? 2886 2889 3405 ? 3593 3593 1215 2771 ? ? ? ? ?
194439.1 Chlorobium tepidum TLS [B] ? ? ? 2235 ? ? ? 555 ? 564 1907 16 ? 554 1473/1489 85 ? ? ? ? ? ?
203122.1 Microbulbifer degradans 2-40 [B] ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 246 2807 2658 ? 267 267 3220 ? ? ? 2718 ? ?
203124.1 Trichodesmium erythraeum IMS101 [B] ? ? ? ? 3555 ? ? 2965 ? 2966 1215 3910 ? 2882 2882 2064/1940 ? 3911 ? ? ? ?
226186.1 Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 [B] ? ? ? ? ? ? ? 3183 ? 3163 1560 2011 ? 205 205 3915 ? 1913 ? 2396 ? ?
228410.1 Nitrosomonas europaea ATCC 19718 [B] ? ? ? ? ? ? ? 1813 ? 66 2027 345 ? 1817 1817 1418 ? ? ? ? ? ?
235279.1 Helicobacter hepaticus ATCC 51449 [B] ? ? ? ? ? ? ? 17 ? 1839 1833 351 ? 1008 miss 1296 ? ? ? ? ? ?
243090.1 Pirellula sp. 1 [B] ? ? ? ? ? 5876 ? 2083 ? 4146 3705 4708 ? 3169 3169 1104 ? ? ? ? ? ?
258594.1 Rhodopseudomonas palustris CGA009 [B] ? ? ? ? ? ? ? 1049 ? 1050 1048 162 ? 1974 1974 3356 ? ? ? ? ? ?
264462.1 Bdellovibrio bacteriovorus HD100 [B] 1647 ? ? ? ? ? ? 2866 ? 3418 2526 3522 ? 3513 3513 2908 ? ? ? ? ? ?
267671.1 Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 [B] ? ? ? ? ? ? ? 2186 ? 2877 983 2689 ? 1045 1045 miss ? ? ? ? ? ?
269484.1 Ehrlichia canis str. Jake [B] ? ? ? ? ? ? ? miss 504 513 676 ? 687 687 356 ? ? ? ? ? ?
272631.1 Mycobacterium leprae TN [B] ? ? ? ? ? ? ? 760 ? 759 761 898 ? 900 900 841 ? ? ? ? ? ?
GenomeIDOrganism TDO IDO KFA_e KFA_b KMO KYN HAD ASPOX ASPDH QSYN QAPRT NAMNAT NMNAT NADS GAT NADK NAM NAPRT NMPRT PNUC RNK_b RNK_e