Variant 1 for NAD and NADP cofactor biosynthesis global (with 298 genomes present) (functional: [B3 -> NADP]; var fc5)

Statistics
1 Eukaryota (out of 16), 38 Bacteria (out of 261) and 0 Archaea (out of 21) match this variant.
Pathway graph
Note: required functional roles are shown in green box while the optional ones in gray



Annotation spreedsheet
Note 1: annotations for required functional roles are shown in green; click for details;
Note 2: enzymes with the same function are treated equally;
Note 2: each row (organism) contains no more than 2 cells of "miss" (missing gene) or genes (which are annotated in this organism but is optional in above pathway).
GenomeIDOrganism TDO IDO KFA_e KFA_b KMO KYN HAD ASPOX ASPDH QSYN QAPRT NAMNAT NMNAT NADS GAT NADK NAM NAPRT NMPRT PNUC RNK_b RNK_e
39947.1 Oryza sativa (japonica cultivar-group) [E] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? miss ? 3473 3473 6281 miss 2083 ? ? ? ?
224914.1 Brucella melitensis 16M [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 209 ? 968 968 1035 545 1835 ? ? ? ?
93061.1 Staphylococcus aureus NCTC 8325 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 621 ? 1433/287 miss 76 2551 1434 ? ? ? ?
192222.1 Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1323 ? 749 miss 602 108 203 ? ? ? ?
159288.1 Staphylococcus aureus EMRSA-16 (Str. 252) [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2419 ? 516 miss 2136 510/637 515 ? ? ? ?
159289.1 Staphylococcus aureus MSSA (Str. 476) [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 788 ? 1374 miss 1337 1368/1597 1373 ? ? ? ?
196620.1 Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1545 ? 1853 miss 888 161/1859 1854 ? ? ? ?
158878.1 Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1594 ? 1912 miss 1007 187/1918 1913 ? ? ? ?
158879.1 Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1469 ? 1781 miss 889 1787/185 1782 ? ? ? ?
176280.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1280 ? 1596 miss 696 1601 1597 ? ? ? ?
208435.1 Streptococcus agalactiae 2603V/R [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1617 ? 295 miss 1067 1629 294 ? ? ? ?
211110.1 Streptococcus agalactiae NEM316 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1671 ? 285 miss 1137 1683 284 ? ? ? ?
1336.1 Streptococcus equi subsp. zooepidemicus [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2136 ? 1992 miss 880 2098 1991 ? ? ? ?
210007.1 Streptococcus mutans UA159 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1631 ? 421 miss 951 1655 420 ? 857 ? ?
160490.1 Streptococcus pyogenes M1 GAS [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 150 226 ? 1274 miss 857 1368 1275 ? ? ? ?
1314.1 Streptococcus pyogenes M5 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1181 1810 ? 358 miss 1015 257 357 ? ? ? ?
198466.1 Streptococcus pyogenes MGAS315 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1013 226 ? 1392 miss 785 1543 1393 ? ? ? ?
186103.1 Streptococcus pyogenes MGAS8232 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1111 229 ? 1371 miss 874 1524 1372 ? ? ? ?
193567.1 Streptococcus pyogenes SSI-1 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 845 1634 ? 470 miss 986 323 469 ? ? ? ?
1308.2 Streptococcus thermophilus ACTT BAA-491 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1561 ? 400 miss 157 532 401 ? ? ? ?
212717.1 Clostridium tetani E88 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1841 ? 569 569 1405 588 855 ? ? ? ?
235.1 Brucella abortus [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2321 ? 583 583 1573 797 1182 ? ? ? ?
204722.1 Brucella suis 1330 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1779 ? 979 979 905 1417 110 ? ? ? ?
1063.1 Rhodobacter sphaeroides [B] ? ? ? ? ? 2155 ? ? ? ? 3659 1366 ? 2360 2360 2884 1606 1607 ? ? ? ?
1255.1 Pediococcus pentosaceus [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1530 ? 1172 miss 380 1080 1171 ? ? ? ?
1596.1 Lactobacillus gasseri [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1489 ? 1197 miss 1519 170 1196 ? 266 ? ?
67825.1 Citrobacter rodentium [B] ? ? ? ? ? ? ? 11711/12632/1787/9586 ? ? ? 6786 ? 3964 miss 353/10718/1475/7796 548 19849/2169 ? ? ? ?
119072.1 Thermoanaerobacter tengcongensis [B] ? ? ? 2431/944 ? ? ? ? ? ? ? 857 ? 591 591 1207 1716 816 ? ? ? ?
203267.1 Tropheryma whipplei str. Twist [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 469 ? 405 miss 103 692 623 ? ? ? ?
218496.1 Tropheryma whipplei TW08/27 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 277 ? 343 miss 103 677 611 ? ? ? ?
220668.1 Lactobacillus plantarum WCFS1 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1268 ? 474 362 1846 2161 2284/473 ? 468 ? ?
224326.1 Borrelia burgdorferi B31 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1166 ? 906 miss 695 1280 1019 ? ? ? ?
226185.1 Enterococcus faecalis V583 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2676 ? 2449 miss 2491 2980 2450 ? 672 ? ?
243275.1 Treponema denticola ATCC 35405 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1734 ? 1389 1389 1580 miss 173 ? ? ? ?
243276.1 Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 737 737 776 776 440 692 625 ? ? ? ?
257314.1 Lactobacillus johnsonii NCC 533 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1428 ? 1524 miss 665 1115 1525 ? 1598 ? ?
272632.1 Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 417 ? 415 miss 290 996/973 653 ? ? ? ?
272633.1 Mycoplasma penetrans HF-2 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 520 ? 195 miss 460 miss 939 ? ? ? ?
273119.1 Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970 [B] ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 476 ? 467 miss 179 miss 280 ? ? ? ?
GenomeIDOrganism TDO IDO KFA_e KFA_b KMO KYN HAD ASPOX ASPDH QSYN QAPRT NAMNAT NMNAT NADS GAT NADK NAM NAPRT NMPRT PNUC RNK_b RNK_e