The domain linkers (bridges) and their phylogenetic profiles

Phylogenetic profiles (genomes list) are represented as strings of + and -, standing for presence and absence of the domain/combination in a genome, respectively; Move mouse to the colored symbols for the genome information (green, red and blue for Archaeal, Bacterial and Eukaryotic genomes respectively)

Bridge 1: (MMR_HSR1 -- KH_2)
MMR_HSR1 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + +
KH_2 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - - + + + + + +
MMR_HSR1 -- KH_2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + - + + - + + + + + + + + + - + - - - - + + + - - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + - + + - + + + + + + + + + - + - - - - + + + - - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
view the linker in corresponding genomes Aae Ama Asp Asp2 Asp3 Atu Ava Bab Bab2 Ban Ban2 Ban3 Bap Bap2 Bap3 Bba Bbr Bbu Bce Bce2 Bce3 Bcl Bfr Bfr2 Bga Bha Bhe Bja Bli Blo Bma Bme Bpa Bpe2 Bps Bps2 Bqu Bsp Bsu Bsu2 Bth Bth2 Cac Cbu Cch Ccr Cdi Cef Cglu Chy Cje Cje2 Cje3 Cpe Cps Cte Cte2 Cvi Dar Dde Dps Dra Dvu Eca Eca2 Eco Eco2 Eco3 Eco4 Efa Eli Eru Eru2 Fnu Ftu Gka Gme Gox Gsu Gvi Hdu Hhe Hin Hin2 Hpy Hpy2 Ilo Lac Lin3 Ljo Lla Lmo Lmo2 Lpl Lpn Lpn2 Lpn3 Lsa Lxy Mbo Mca Mfl Mga Mge Mhy Mhy2 Mhy3 Mle Mmo Mmy Mpa Mpe Mpn Mpu Msu Msy Mtu Mtu2 Neu Nfa Ngo Nme Nme2 Nmu Noc Nwi Oih Oye Pac Pae Par Pca Pfl Pfl2 Pgi Pha Plu Plu2 Pma Pma2 Pma3 Pma4 Pma5 Pmu Ppr Ppu Psy Psy2 Psy3 Rco Reu Rfe Rlo Rme Rpa Rpr Rso Rsp Rty Sag Sag2 Sag3 Sau Sau2 Sau3 Sau4 Sau5 Sau6 Sau7 Sav Sbo Sch Sco Sdy Sel Sep Sep2 Sfl Sfl2 Sha Smu Son Spa Spn Spn2 Spom Spy Spy2 Spy3 Spy4 Spy5 Spy6 Spy7 Ssa Sso Ssp Ssp2 Ssp3 Ssp4 Ssp5 Ssp6 Sth2 Sth3 Sth Sty Sty2 Sty3 Tcr Tde Tde2 Tde3 Tfu Tma Tpa Tte Tth Tth2 Twh Twh2 Upa Vch Vfi Vpa Vvu Vvu2 Wpi Wsp Wsu Xax Xca Xca2 Xca3 Xfa Xfa2 Xor Ype Ype2 Ype3 Yps Zmo Ath
Bridge 2: (CBS -- SIS)
CBS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + + + + + + + + + + + +
SIS + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + - + + + - + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
CBS -- SIS - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + - + + - + + - - - - - - + + - - - - - + - - - - + + - - + + + + + + + + + - + - - + - + + + + - - - - + + - + - + + + + + + - + + + + + - + - - + - + + + + + - - - - + + - + + + - + + + + + + + - + + - - - - - - + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - + - - - - - + + + - + + - - - + + + + + - + + + - - - + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - + + - + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + + + + + + - - - - + + + + + + - - - - - - - - - - + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + - + + - + + - - - - - - + + - - - - - - - - - - + + - - + + + - + + + + + - + - - - - + - + + - - - - + + - - - - - - - + + - - - + + + - + - - + - + + + + + - - - - + + - - + - - + + + + - - + - + + - - - - - - + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - + - - - - - + + + - + + - - - + + - + + - + + + - - - + - + + + - + + + + + - + - + + + - + + - - - - - - - - - - - - + + - + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + + + + + + - - - - + + + + + + - - - - - - - - - - + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 3: (GATase_2 -- SIS)
GATase_2 + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + - + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - + - - + - - - + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + +
SIS + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + - + + + - + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
GATase_2 -- SIS - + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + - - - - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - + - - + - - - + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + - + + - + + - - - - - - - + - - - - - - - - - - - + - - + + + - + + + - + - + - - - - + - + + - - - - + + - - - - - - - + + - - - + + + - + - - + - + + + + + - - - - - + - - + - - - - - - - - + - + + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + - - - + + - + + - + + + - - - + - - + + - + + + + + - + - + + + - + + - - - - - - - - - - - - + + - + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + + + + + + - - - - + + + + + + - - - - - - - - - - + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 4: (CBS -- ABC_tran)
CBS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + + + + + + + + + + + +
ABC_tran + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +
CBS -- ABC_tran - - - - + + - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + + - - - - + - + + + + - + + - - - - + - + + + - + + + - + + + + + - + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - + - - + - + - + - - + - + + + + + + - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - + - - - - - - + - + + - - + + - - - + - - - - - - + + - + + + + - - + - - + - - + + - + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + - - - + + + + + + + + + - - - - - - - + - + + + - - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - - - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + + - - - - + - + - - + - + + - - - - + - + + + - + + + - + + + - + - + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - + - - + - + - + - - + - + + + + + + - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - + - - - - - - + - + + - - + + - - - + - - - - - - + + - + + + + - - - - - + - - + + - + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + - - - + + + + + + + + + - - - - - - - + - + + + - - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - - - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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